大棚蔬菜复种指数高、产量高、需肥量大。底肥对蔬菜的产量、品质及土壤性状影响很大，是施肥中最基本的一个环节，对蔬菜作物生长发育至关重要。
一、底肥的种类要全
底肥的种类要满足粪肥（猪粪、牛粪、羊粪、鸡粪等）、复合肥、微生物菌肥、中微量元素肥（钙、硼、锌尤为重要），这四种肥各有各的作用，因此一定要施全。
二、粪肥一定要腐熟，而且越多越好
不管是什么粪，一定要发酵好，而且一定要翻到地下，使用未腐熟的粪肥，易导致烧根等一系列问题。发酵好的粪肥，施用量越多越好，具体到实际生产中，一亩地怎么也得施用5000kg以上。
三、不要过量使用复合肥
粪可以多用，但是复合肥适量就好，一般做底肥用的平衡性复合肥(如15-15-15)使用量70公斤左右就够了，使用过多往往会导致土壤的盐渍化，甚至引起作物中微量元素缺失等，另外底施硼肥用一点就够，以五水硼酸钠为例，一亩地使用200克就够用，如果多了，反倒会引起硼中毒。
四、提倡高垄栽培
采用高垄栽培后，根系生长空间更大，根系周围土壤透气性更好，这样根系吸收水分养分的能力就会更强，产量就会更高，同时采用高垄栽培后还可以有效的减少土传病害的发生。
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